課程資訊
課程名稱
生物資訊學導論
Introduction to Bioinformatics 
開課學期
109-1 
授課對象
學程  幹細胞與再生醫學學程  
授課教師
陳虹諺 
課號
Agron5050 
課程識別碼
621EU6390 
班次
 
學分
3.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期五6,7,8(13:20~16:20) 
上課地點
 
備註
本課程以英語授課。教室:生物產業自動化中心(鄭江樓505室)與劉力瑜合授
總人數上限:45人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1091Agron5050_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程介紹生物資訊學相關技術與資料分析方法。考量生物資訊學隨生物技術快速發展迅息萬變,課程內容主要來自近年最新發表的期刊論文,配合利用自由軟體 (open source software,如:R、Bioconductor等) 進行實際資料分析的演練。內容包含: (A) Introduction, (B) Microarray data analysis, (C) Sequence analysis, and (D) Advanced topics. 

課程目標
使學生對生物技術原理有概念性的了解,並具備實際資料分析與解釋其生物意義的基礎能力。Introduce current status of development of bioinformatics technologies through lecturing and paper readings. 
課程要求
homework 100% (兩位老師各半) 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
待補 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/18  Introduction - Liu 
第2週
9/25  Introduction to R - Chen 
第3週
10/02  <font color = "#0000FF"> Holiday</font> 
第4週
10/09  <font color = "#0000FF"> Holiday</font> 
第5週
10/16  Basic statistics I - Chen 
第6週
10/23  Basic statistics II - Chen 
第7週
10/30  R and Bioconductor - Liu 
第8週
11/06  Microarray Techniques - Liu 
第9週
11/13  Microarray Data Normalization & Visualization - Liu 
第10週
11/20  AffylmGUI / practice - Liu 
第11週
11/27  Modern Sequencing Methods - Liu 
第12週
12/04  Sequence Alignment & Assembly - Liu 
第13週
12/11  RNA-Seq / DEseq practice - Liu 
第14週
12/18  Comparative Genomics & Phylogeny - Liu 
第15週
12/25  Network Analysis - Liu 
第16週
1/01  <font color = "#0000FF"> Holiday</font> 
第17週
1/08  Gene Ontology and Annotation - Liu